額外模式的選單畫面
額外模式（エクストラモード/Extra Mode）是在洛克人exe WS當中可以選用的隱藏模式。它是在全破第二輪遊戲並取得綠色星之證明
之後出現的模式，能夠與所有遊戲中的頭目進行連續對決。
額外模式共有四個難度（練習、額外、困難、EX困難），其中EX困難只有在地圖的探索完成率達到100%而取得紅色星之證明
之後才會出現，各種難度的主要差別是給予玩家的資源有所差異，頭目本身的強度並不會改變。
頭目順序[]
| 順序 | 出現頭目 |
|---|---|
| 1 | 火焰人.exe |
| 2 | 電氣人.exe |
| 3 | 色彩人.exe |
| 4 | 魔術人.exe |
| 5 | 法老王人.exe |
| 6 | 炸彈人.exe |
| 7 | 蛇人.exe |
| 8 | 火焰人V2 |
| 9 | 電氣人V2 |
| 10 | 布魯斯.exe |
| 11 | 夢幻病毒 |
| 12 | 福音獸 |
| 13 | 佛魯迪.exe |
難易度差異[]
| 難度 | 連戰場數 | 戰鬥晶片 | 型態轉換 | 單場戰後回復量 |
|---|---|---|---|---|
| 練習 | 11（夢幻病毒為止） | 全種類各一張 | 有 | 全回復 |
| 額外 | 12（福音獸為止） | 全種類各一張 （除強化裝備三種外） |
有 | 100 |
| 困難 | 12（福音獸為止） | 回復20×4 回復20×4 |
有 | 60 |
| EX困難 | 13（佛魯迪為止） | 回復20×4 回復20×4 |
無 | 無 |
成績結算[]
在連續戰鬥的最後不管有否成功都會被給予一個等級（SSS、SS、S、A-H共十一個等級），影響等級的分數包含：連勝的場數、每一場的時間、每一場的攻擊行動次數、每一場是否使用戰鬥晶片或程式強化、每一場結束時的體力值。