秘密晶片（シークレットチップ/Secret Chip）是在洛克人exe系列中因為罕見而不會記載在資料圖書館本身而會另開新頁面記錄的戰鬥晶片。本頁面列出所有在洛克人exe6當中的秘密晶片。
《新・我們的太陽》連動
| 編號 | 中文名 | 日文名 |
|---|---|---|
| 01 | 太陽銃EX | ガンデルソルEX |
| 02 | 天鼓大人 | オテンコサマ |
兇牙版限定
| 編號 | 中文名 | 日文名 |
|---|---|---|
| 03 | 水人 | アクアマン |
| 04 | 水人EX | アクアマンEX |
| 05 | 水人SP | アクアマンSP |
| 06 | 鉞人 | トマホークマン |
| 07 | 鉞人EX | トマホークマンEX |
| 08 | 鉞人SP | トマホークマンSP |
| 09 | 天狗人 | テングマン |
| 10 | 天狗人EX | テングマンEX |
| 11 | 天狗人SP | テングマンSP |
| 12 | 地面人 | グランドマン |
| 13 | 地面人EX | グランドマンEX |
| 14 | 地面人SP | グランドマンSP |
| 15 | 塵埃人 | ダストマン |
| 16 | 塵埃人EX | ダストマンEX |
| 17 | 塵埃人SP | ダストマンSP |
翔羽版限定
| 編號 | 中文名 | 日文名 |
|---|---|---|
| 03 | 高熱人 | ヒートマン |
| 04 | 高熱人EX | ヒートマンEX |
| 05 | 高熱人SP | ヒートマンSP |
| 06 | 電氣人 | エレキマン |
| 07 | 電氣人EX | エレキマンEX |
| 08 | 電氣人SP | エレキマンSP |
| 09 | 切削人 | スラッシュマン |
| 10 | 切削人EX | スラッシュマンEX |
| 11 | 切削人SP | スラッシュマンSP |
| 12 | 殺手人 | キラーマン |
| 13 | 殺手人EX | キラーマンEX |
| 14 | 殺手人SP | キラーマンSP |
| 15 | 衝鋒人 | チャージマン |
| 16 | 衝鋒人EX | チャージマンEX |
| 17 | 衝鋒人SP | チャージマンSP |
配信晶片
在本作當中，配信晶片當中的兇牙及翔羽只能在相對應的版本中入手。
| 中文名 | 日文名 |
|---|---|
| 雙重獸化 | ダブルビースト |
| 兇牙 | グレイガ |
| 翔羽 | ファルザー |
連鎖領航員專用晶片
布魯斯.exe專用的踏入斬性能與標準晶片相同，但攻擊力會隨著布魯斯的性能改變。
行動對戰專用晶片
| 中文名 | 日文名 |
|---|---|
| 拳手臂 | パンチアーム |
| 針手臂 | ニードルアーム |
| 脈衝手臂 | パルスアーム |
| 回力鏢手臂 | ブーメランアーム |
| 同步激發 | シンクロトリガー |
| 黑暗劍 | ダークソード |
| 黑暗閃電 | ダークサンダー |
| 黑暗回復 | ダークリカバリー |
| 黑暗隱身 | ダークインビジ |
| 黑暗增加 | ダークプラス |
跨界對戰2專用晶片
| 中文名 | 日文名 |
|---|---|
| 蝙蝠加農炮1 | バットキャノン1 |
| 蝙蝠加農炮2 | バットキャノン2 |
| 蝙蝠加農炮3 | バットキャノン3 |
| 蝙蝠加農炮4 | バットキャノン4 |
| 獸化 | ビーストアウト |
| 洛克人exe6：道具 |
|---|
| 重要道具・標準晶片・MEGA級晶片・GIGA級晶片・秘密晶片・程式強化・改造卡 改造零件・HP記憶體・常規上升・副晶片・副記憶體・擴張記憶體・病蟲碎片 |