究極程式（究極のプログラム/Superprogram）是在洛克人exe系列當中登場的火焰程式、水程式、電氣程式、木程式四種程式的總稱。究極程式是擁有最為純粹的屬性的程式，傳說是過去在建構電腦世界時由一位偉大的學者所設計，能夠有效地提升相對應屬性的電腦系統的性能。
洛克人exe
在洛克人exe當中，威利博士試圖藉由收集四種究極程式製作出沒有弱點的夢幻病毒，再以夢幻病毒駭入R國的軍事衛星引發終末戰爭。
洛克人exe WS
威利博士會相信究極程式是被安裝在一再打敗WWW網路領航員的洛克人.exe身上，並且製作出最強的夢幻病毒試圖打倒洛克人以奪取究極程式。
洛克人exe動畫版
在動畫版中，威利博士認為究極程式會被安裝在參加N1大賽的網路領航員當中，並且派遣石頭人.exe與炸彈人.exe尋找這個擁有究極程式的網路領航員。
在動畫版中被確認的究極程式總共有三組，第一組是光正為了要有效管理網際網路而設計的程式，被安裝在法老王人.exe當中，但也因為法老王人的思考程式存在有病蟲而與法老王人一起被封印。在法老王人復活並且被刪除之後，在法老王人殘存資料當中的究極程式會在威利博士的處理之下變化成佛魯迪.exe及福音獸。
第二組被確認的究極程式是在洛克人.exe的身上，似乎是洛克人能夠進行型態轉換的關鍵程式。它會與佛魯迪身上的究極程式共鳴而產生病蟲型態。
第三組究極程式位在布魯斯.exe的身上，但有什麼功能則沒有明確提及。
落入威利博士手中的究極程式